下位カテゴリ商品が表示されるよう設定されている可能性が考えられます。
下記設定項目をご確認ください。
管理画面「商品>カテゴリ設定>カテゴリ設定>商品カテゴリ管理>」から該当カテゴリをクリックします。
カテゴリ情報の「下位カテゴリ商品の表示」項目が「表示する」に設定されている場合、該当商品カテゴリの下位カテゴリにある商品まですべて表示されます。
「表示する」チェックが入っている場合は、「下位カテゴリ商品の表示」項目を「表示しない」に変更ください。
下記設定項目をご確認ください。
管理画面「商品>カテゴリ設定>カテゴリ設定>商品カテゴリ管理>」から該当カテゴリをクリックします。
カテゴリ情報の「下位カテゴリ商品の表示」項目が「表示する」に設定されている場合、該当商品カテゴリの下位カテゴリにある商品まですべて表示されます。
「表示する」チェックが入っている場合は、「下位カテゴリ商品の表示」項目を「表示しない」に変更ください。